Enzymologie

 Avant 1961, les enzymes ont été dénommées selon le nom du Substrat  sur lequel elles agissent en ajoutant le suffixe "ase".

Il existe deux types de NOMENCLATURE

Avant de donner les bases des deux types de classification, rappelons brièvement les propriétés des enzymes :
1-  sont des protéines, de masse moléculaire élevée, thermolabiles, biocatalyseurs des
réactions métaboliques.
2-  agissent à des concentrations très faibles.
3-  possèdent une spécificité étroite ou lâche avec le substrat.
4-  augmentent la vitesse des réactions sans modifier leur état d’équilibre.
5-  doivent être régénérées à la fin de la réaction ou de la séquence des réactions.
2.1 – FONCTIONNELLE
Elle est très utilisée. Elle prend en compte le nom du substrat de l’enzyme et le type
de réaction catalysée. Pour désigner une enzyme on indique :
1-  d'abord le nom du substrat
2-  puis le type de réaction catalysée
3-  on ajoute enfin le suffixe ase.
Par exemple :
- glucose-6-phosphate isomérase
- Isocitrate lyase
- pyruvate carboxylase

Lorsque l'enzyme utilise 2 substrats on les désigne tous les deux en indiquant
1-  le substrat donneur de radicaux
2-  puis le substrat accepteur du radical libéré
3-  le radical échangé
4-  le type de réaction
5-  on ajoute enfin ase.
Exemple :
- ATP-glucose phosphotransférase
- UDPglucose-fructose glucosyltransférase
- Glutamate pyruvate aminotransférase.
2.2 - NOMENCLATURE OFFICIELLE DES ENZYMES
Depuis 1961, l'Union Internationale de Biochimie a codifié la nomenclature et la
classification des enzymes sous une nomenclature dite officielle. Toutes les enzymes
actuellement connues sont répertoriées sous un numéro portant 4 nombres séparés par
des points et précédés de EC soit (EC x1.x2.x3.x4). La signification des nombres est la suivante
X1 : Le premier nombre pouvant varier de 1 à 6 indique le type de réactions
1 : Oxydoréductases (transfert d'électrons, d’atomes d’hydrogène ou fixation d’oxygène)
2 : Transférases (transfert d'atomes ou de groupes d'atomes autres que ceux 1)
3 : Hydrolases (Coupure des liaisons avec fixation de radicaux H et OH issus de l’eau)
4 : Lyases (Coupure des liaisons par d'autres modes autres que l'hydrolyse).
5 : Isomérases (réaction conservant la formule brute du composé)
6 : Ligases (formation des liaisons entre C et un autre métalloïde en utilisant l'énergie de l'ATP).

X2 : Le deuxième désigne la sous-classe de l'enzyme qui est définie suivant son
mécanisme d'action. Dans le cas des oxydoréductases on distingue les éshydrogénases, les monooxygénases et les dioxygénases.

X3 : Le 3^e nombre désigne la nature de la molécule qui sert d'accepteur, lorsqu'il s'agit d'un transfert d'électrons.

X4 : Le 4^e nombre est un numéro d'ordre dans le groupe et dans le sous-groupe.
Lorsqu'une enzyme se termine par 99, cela signifie qu'elle est incomplètement caractérisée.